知っておきたい！レンタルサーバー知識

住民税の特別徴収をする場合の所得税の計算について会社で給与計算をしていますが、今年から住民税の特別徴収を行うことになりました。
そこで所得税計算について疑問に思ったのですが、今までは給与から社会保険、雇用保険料を引いた額から所得税を計算していました。
ここに住民税の特別徴収を加えると給与－（社会保険料＋雇用保険料＋住民税）で所得税を計算するのか給与－（社会保険料＋雇用保険料）で計算した所得税－住民税となるのかがわかりません。
わかるかた回答お願いいたします。

愛媛社会保険事務局
県内各事務所の所在地、相談案内、健康保険、厚生年金、国民年金の案内。 ... 広報誌(社会保険えひめ) (7月号をＵＰしました) リンク集. 事件・事故 及び 事務処理誤り ... 愛媛社会保険事務局サービス改善協議会開催結果. 過去のお知らせ ...
http://www.sia.go.jp/~ehime/

社会保険事務局
新潟県内の各社会保険事務所の所在地、交通案内、管轄区域。社会保険制度、国民年金、相談案内等。 ... 社会保険労務士さんのご協力により「ねんきん特別便」に関する無料相談を行っております ... 社会保険出張相談所のご案内. 年金相談の時間延長と休日 ...
http://www.sia.go.jp/~niigata/

社会保険事務局
県内各事務所の所在地、相談案内、健康保険、厚生年金、国民年金の案内。 ... 社会保険(健康保険・厚生年金保険)の加入に関するご相談(20年1月15日更新) ... 鳥取社会保険事務局内における事件・事故及び事務処理誤り(21年7月28日更新) ...
http://www.sia.go.jp/~tottori/